El Campeonato de Tercera División 1949 fue la decimoquinta y última temporada de la tercera división del fútbol argentino bajo este formato. Fue disputado por 11 equipos.

Barracas Central había ascendido a la Segunda División en la temporada anterior.

Los 11 clubes se enfrentaron entre sí a dos ruedas por el sistema de todos contra todos. San Telmo y J.J. de Urquiza terminaron empatados en primera posición con 35 puntos. En el desempate, San Telmo venció 3-1 en la ida y empató 0-0 en la vuelta, consagrándose campeón.

Sin embargo, San Telmo no fue promovido debido a una reorganización de las divisiones de AFA. Sportivo Palermo y Huracán de San Justo se desafiliaron. A partir de 1950, la estructura cambió: muchos clubes de Segunda División fueron relegados a Tercera, y los equipos de Tercera fueron enviados a una nueva Cuarta División.